超净工作台原理是在在特定的空间内，室内空气经预过滤器初滤，由小型离心风机压入静压箱，再经空气高效过滤器二级过滤，从空气高效过滤器出风面吹出的洁净气流具有一定的和均匀的断面风速，可以排除工作区原来的空气，将尘埃颗粒和生物颗粒带走，以形成无菌的高洁净的工作环境。
超净工作台根据气流的方向分为垂直流超净工作台（Vertical Flow Clean Bench）和水平流超净工作台（Horizontal Flow Clean Bench），根据操作结构分为单边操作及双边操作两种形式，按其用途又可分为普通超净工作台和生物（医药）超净工作台。从操作人员数上分：分为单人工作台和双人工作台；超净工作台从结构上分：分为常规型和新型推拉以及自循环型（仅限垂直流）。
超净台的优点是操作方便自如，比较舒适，工作效率 ，预备时间短，开机10分钟以上即可操作，基本上可随时使用。在工厂化生产中，接种工作量很大，需经常长久地工作时，超净台是很理想的设备。超净台由三相电机作鼓风动力，功率145～260W左右，将空气通过由特 的微孔泡沫塑料片层叠合组 的“超级滤清器”后吹送出来，形成连续不断的无尘无菌的超净空气层流，即所谓“ 有效的特殊空气”，它除去了大于0.3μm的尘埃、真菌和细菌孢子等等。超净空气的流速为24～30m/min，这已足够防止附近空气可能袭扰而引起的污染，这样的流速也不会妨碍采用酒精灯或本生灯对器械等的灼烧消毒。工作人员就在这样的无菌条件下操作。
大连无菌净化厂房车间工程通过相应的装置，送入足够量的、经过处理的洁净空气，以替换或稀释室内在正常工作时所产生的污染物质污染的空气;同时，带走室内的污染物质。即为空气净化的基本原理。
具体而言，洁净室内的空气净化处理就是根据房间的不同的洁净度等级要求，采用不同的方式送入经过处理的数量不等的清洁空气，同时排走相应数量的携带有在室内所产生的污染物质沾污的脏空气;依靠这样的动态平衡，使室内环境维持在所需要的空气洁净度等级。
